En 1980, los consejeros generales, Robert Maloney y Meo Elia, en su visita oficial a la Región Xaveriana de México, vieron  la dificultad de que la casa de Guadalajara fuera al mismo tiempo, la sede de la Teología, de la Filosofía, del Superior Regional y del Centro Xavier.

Para dar una solución a esta situación, se decidió buscar una nueva sede para la Teología que ayudara a los teólogos a tener una mejor preparación para la misión. La nueva comunidad debería vivir inserta en un medio popular, para estar más cerca de la gente y poder compartir sus mismas preocupaciones.

Se compró una casa en la zona de San Lorenzo Tezonco, ubicada en delegación de Iztapalapa, y se abrió oficialmente el 26 de julio de 1992, fiesta de los santos Joaquín y Ana. Los primeros estudiantes fueron ocho.

Con el paso del tiempo la casa llegó a ser insuficiente, por lo que se vio la necesidad de buscar una nueva sede para la comunidad de teología.

Esta nueva casa no solo debería estar inserta en un medio popular, sino que además sería una de las cuatro “Teologías Internacionales” en las cuales los futuros xaverianos se prepararían para su futura misión. Y el 25 de marzo del año 2000, los teólogos se trasladaron a la nueva casa ubicada en la colonia Portales.