Nuestra misión como xaverianos es ser enviados a países y grupos humanos no cristianos, fuera de nuestro ambiente, cultura e Iglesia de origen, sobre todo entre las personas más necesitadas. Pero cuando, nos encontramos en nuestro país de origen, apoyamos a la iglesia local siendo disponibles para algún servicio que se nos pida realizar, tratando de crear comunidad.

Es por eso, que parte de nuestra misión, es ayudar a construir las estructuras necesarias para la vida de la comunidad parroquial, pero con la firme convicción de que debe ir unida a la construcción del pueblo de Dios, las verdaderas piedras, que conforman la Iglesia. Durante los cincuenta años de presencia en San Juan del Río, los Xaverianos hemos colaborado en la construcción de varias capillas como son: El Cazadero, El Carmen, el Jazmín, El Sabino, Galindo, Ojo de Agua,  La Concha, La Trinidad, El Organal, El Rosario, El Rodeo, San José Obrero,  Santa Bárbara, entre otras.